Dott. Mario Ventura Tel:+39 080 544 3583 email: m.ventura@biologia.uniba.it
Attivita' didattica - Attivita' accademica - Finanziamenti - Attivita' di ricerca - Collaborazioni - Pubblicazioni - Capitoli di libri

Curriculum Vitae

Studi Superiori: Perito agrario
Diploma di Laurea: Laurea in Scienze biologiche conseguita presso l'Università degli studi di Bari,  il 21 Luglio 1999 con la votazione di 110/110 e lode
Studi Post-Laurea: Dottorato in Genetica ed Evoluzione Molecolare presso il DAPEG Sezione Genetica (Universita’ degli Studi di Bari)

Anno 1997
1/3/1997 Inizio internato per la preparazione della tesi di Laurea nell'Istituto di Genetica dell'Universita' degli Studi di Bari 

Anni 1999-2000
Tirocinante presso l’Universita’ degli Studi di Bari. Dipartimento Anatomia Patologica e di Genetica (DAPEG) Anno 2000

Anno 1999
21/07 Conseguimento della Laurea in Scienze Biologiche presso l’Universita’ degli Studi di Bari con la votazione di110/110 e lode. La tesi di laurea e' stata oggetto di pubblicazione.
29-9/1-10 Partecipazione al 2º congresso SIGU (Orvieto) per la comunicazione rigurdante il "Riposizionamento centromerico nell'evoluzione del cromosoma X nei lemuri".
1/11 Vincitore del Dottorato di Ricerca in Genetica ed Evoluzione Molecolare
14-18/11 Partecipazione al 1º corso in Citogenetica Molecolare (Sestri Levante)

Anno 2000
Responsabile del “Progetto Giovani Ricercatori” per “Allestimento di banche di bacs come risorsa per la citogenetica molecolare”presso l’Universita’ degli Studi di Bari
19-21/6 Corso A.G.I. “Analisi strutturale e funzionale del genoma” Crotona (AR)

Anno 2001
11/00-8/01 Attivita’ di ricerca presso il  laboratorio di Genetica Umana (direttore Tom Strachan) sotto la coordinazione del dr. Michael Stuart Jackson (Newcastle upon Tyne, Inghilterra)
19-22/4 Presentazione poster su “Il riposizionamento dei centromeri nei Lemuri” all’ HGM 2001 Edimburgo, Scozia
1/6-30/8 Vincitore di borsa di studio EMBO (short term fellowship) per lo svolgimento del progetto di ricerca: “Evolution of pericentromeric region and their plasticity” nel laboratorio di Genetica Umana (direttore Tom Strachan)
12-16/10 Partecipazione al 51º “Annual Meeting” dell’American Society Human Genetics A.S.H.G. San Diego, California
18-20/11 Presentazione poster per la X Convention Scientifica “Telethon”.Riva del Garda
28-30/11 IV Congresso Nazionale della Societa’ Italiana di Genetica Umana (S.I.G.U.) Orvieto (TN)     

Anno 2002
20-24/8 Parteciapzione al 4º Corso in “Molecular Cytogenetics and DNA Arrays” organizzato dall’ European School of Genetic Medicine, Bertinoro (BO)
24-27/9 IV Congresso Nazionale della Societa’ Italiana di Genetica Umana (S.I.G.U.) Verona
15-19/10 Partecipazione al 52º “Annual Meeting” dell’American Society Human Genetics A.S.H.G. Baltimora, Maryland
31/10 Conclusione del corso di Dottorato di Ricerca in Genetica ed Evoluzione Molecolare  
1/12 Vincitore di contratto di collaborazione coordinata e continuativa, della durata di tre anni, nell’ambito del progetto di ricerca finanziato dalla Comunità Europea “INPRIMAT” 

Anno 2003
07/03 Conferimento del titolo di dottore di Ricerca in Genetica ed Evoluzione Molecolare presso l’Universita’ degli Studi di Bari
10/03 Vincitore valutazione comparativa per 1 posto di Ricercatore nel settore BIO/18 presso la Facolta’ di Biotecnologie dell’Universita’ degli Studi di Bari 

Anno 2004
02/01 Assunzione come Ricercatore presso la Facolta’ di Scienze Biotecnologiche (Universita’ degli Studi di Bari)
10/08 Membro del Quality Board presso INPRIMAT (Research Infrastructure to Promote Primate Molecular Biology)
25-26/09 Membro della faculty per il Simposio “Human Genome Evolution”
01/10 Comunicazione “Centromere reuse in the evolution” all’ “arrayCGH and Molecular Cytogenetic conference” (Cambridge)
26-30/10 Poster selezionato “Centromere Reuse” per l’American Society of Human Genetics (Toronto)  

Anno 2005
18-19/01 Frequenza corso RT-PCR presso il Dipartimento Microbiologia, Universita’ degli Studi di Bari
1-4/02 Corso di Microscopia confocale presso il Labo-Biotech, Scienze Biotecnologiche, Universita’ degli Studi di Bari
20-22/10 Comunicazione “Evolutionary Centromere reposistioning” “arrayCGH and Molecular Cytogenetic conference” (Bari)  

Anno 2006
26/07Assegnazione Borsa Fulbright per periodo permanenza di sei mesi a Seattle (WA) presso il laboratorio del Prof. E.E. Eichler, in qualita di Assistant Professor presso l’Universita’ di Washington (Seattle, WA)

Anno 2007
03-11/07 Assistant professor presso l’Universita’ degli Studi di Washington, in qualita’ di Fulbright Research Scholar per il Research Project: Human Genome Structural Variation and Genetic Disease.

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Attivita' Didattica:

AA 2000-2001: Attivita’ didattica in quanto dottorando nel corso di Citogenetica della facolta’ di Scienze Biologiche con il Prof. Mariano Rocchi

AA 2001-2002: Attivita’ didattica in quanto dottorando per la parte di esercitazioni nel corso di Genetica e Citogenetica del corso di laurea in Scienze Biosanitarie (facolta’ Scienze MM. FF. NN) con i professori Gioacchino Palumbo e Nicoletta Archidiacono

AA 2002-2003: Attivita’ didattica in quanto dottorando per la parte di esercitazioni e Citogenetica nel corso di Genetica e Citogenetica del corso di laurea in Scienze Biosanitarie (facolta’ Scienze MM. FF. NN) con il professor Gioacchino Palumbo  

AA 2002-2003: Attivita’ didattica per l’insegnamento di Genetica ed Ingegneria Genetica presso la facolta’ di biotecnologie Sanitarie e Farmaceutiche in collaborazione con il Prof. Mariano Rocchi

AA 2003-2004: Assegnazione del corso di Genetica ed Ingengeria Genetica del Corso di Laurea in Biotecnologie Sanitarie e Farmaceutiche presso la Facolta’ di Scienze Biotecnologiche.

AA 2004-2005: Assegnazione del corso di Genetica con Ingengeria Genetica del Corso di Laurea in Biotecnologie Sanitarie e Farmaceutiche presso la Facolta’ di Scienze Biotecnologiche

AA 2004-2005: Assegnazione del corso di Terapia Genica e Laboratorio di Citogenetica Umana Corso di laurea specialistica in Biotecnologie Mediche e Medicina Molecolare presso la facolta’ di Scienze Biotecnologiche.

AA 2005-2006: Assegnazione del corso di Genetica con Ingengeria Genetica del Corso di Laurea in Biotecnologie Sanitarie e Farmaceutiche presso la Facolta’ di Scienze Biotecnologiche

AA 2006-2007: Assegnazione del corso di Genetica con Ingengeria Genetica del Corso di Laurea in Biotecnologie Sanitarie e Farmaceutiche presso la Facolta’ di Scienze Biotecnologiche

AA 2007-2008: Assegnazione del corso di Genetica con Ingengeria Genetica del Corso di Laurea in Biotecnologie Sanitarie e Farmaceutiche presso la Facolta’ di Scienze Biotecnologiche

AA 2007-2008: Assegnazione del corso di Genetica Medica con Laboratorio di Malattie Genetiche del Corso di Laurea in Biotecnologie Sanitarie e Farmaceutiche presso la Facolta’ di Scienze Biotecnologiche

 
Nel corso di questi anni ho seguito e firmato come correlatore delle tesi sperimetali di Laurea dei laureandi: Cardone Maria Francesca, Pazienza Michele, Palumbo Valeria, Caratozzolo Mariano e Antonacci Francesca presso la Facolta’ di Scienze MM. FF. NN e come relatore per i tirocini formativi di vari laureandi presso la Facolta’ di Scienze Biotecnologiche.

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Attivita' Accademica:

-Componente del Servizio Tirocinio della Facolta' di Scienze Biotecnologiche;
-Componente della Commissione Tirocini della Facolta’ di Scienze Biotecnologiche;
-Componente del Collegio dei Docenti della Scuola di Dottoarato in Genetica ed Evoluzione Molecolare (Coordinatore Prof. Mariano Rocchi)

Come componente unita' operativa:
- Telethon 2001
- Telethon 2002
- INPRIMAT (UE 2002 triennale)
- PRIN 2002
- PRIN 2003
- Adesione AL PRIN 2004 il Programma di Ricerca dal titolo: Plasticita’ del genoma. Responsabile Scientifico dell'unità di Ricerca: Rocchi Mariano.
- Adesione Al PRIN 2005 Titolo dell'Unità di Ricerca: Nuovo approccio metodologico per svelare piccole inversioni paracentriche. Responsabile Scientifico dell'unità di Ricerca: ARCHIDIACONO Nicoletta

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Finanziamenti

Come responsabile:
- Finanziamento di Ateneo (60%) 2004 (aggregazione di tre docenti, in collaborazione con il Prof. Mariano Rocchi e la Prof.ssa Nicoletta Archidiacono)
- Assegno di Ricerca biennale sul Progetto: “Costruzione di contigui di BAC mediante screening di librerie genomiche per la caratterizzzione delle regioni pericentroeriche in Primati” assegnato alla Dott.ssa Cardone Maria Francesca
- Finanziamento di Ateneo (60%) 2005 (aggregazione di quattro docenti, in collaborazione con il Prof. Mariano Rocchi e la Prof.ssa Nicoletta Archidiacono e la Dott.ssa Clelia Tiziana Storlazzi)

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Collaborazioni:
- Prof. E.E.Eichler University of Washington: Department of Genome Science Seattle USA
- Prof. Giuliano Della Valle, Universita' di Bologna
- Dr. Pieter de Jong, Children's Hospital Oakland Research Institute: BACPAC Resources Oakland USA
- Prof. Tom Strachan e Dr. M.S. Jackson, University of Newcastle: The Institute of Human Genetics. The International Centre for Life. Newcastle upon Tyne UK
- Dr. Roscoe Stanyon, National Cancer Institute: Laboratory of Genomic Diversity Frederick
- Prof. Petere Warburton, Mount Sinai School of Medicine Dept. of Human Genetics, New York USA

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Pubblicazioni:

Pubblicazioni triennio 2004-2007

1. Ventura A, Antonacci F, Cardone MF, Stanyon R, D'Addabbo P, Cellamare A, Sprague LJ, Eichler EE, Archidiacono N, Rocchi M: Evolutionary formation of new centromeres in macaque. Science 316:243-246 (2007) I.F. 30.028
2. Mefford HC, Clauin S, Sharp AJ, Moller RS, Ullmann R, Kapur R, Pinkel D, Cooper GM, Ventura M, Ropers HH, Tommerup N, Eichler EE, Bellanne-Chantelot C: Recurrent reciprocal genomic rearrangements of 17q12 are associated with renal disease, diabetes, and epilepsy. Am J Hum Genet 81:1057-69 (2007) I.F. 12.629
3. Jiang Z, Tang H, Ventura M, Cardone MF, Marques-Bonet T, She X, Pevzner PA, Eichler EE: Ancestral reconstruction of segmental duplications reveals punctuated cores of human genome evolution. Nat Genet (2007) I.F. 24.176
4. Cardone MF, Lomiento M, Teti MG, Misceo D, Roberto R, Capozzi O, D'Addabbo P, Ventura M, Rocchi M, Archidiacono N: Evolutionary history of chromosome 11 featuring four distinct centromere repositioning events in Catarrhini. Genomics 90:35-43 (2007) I.F. 3.558
5. Alkan C, Ventura M, Archidiacono N, Rocchi M, Sahinalp SC, Eichler EE: Organization and evolution of primate centromeric DNA from whole-genome shotgun sequence data. PLoS Comput Biol 3:1807-1818 (2007) I.F. 4.914
6. She X, Liu G, Ventura M, Zhao S, Misceo D, Roberto R, Cardone MF, Rocchi M, Green ED, Archidiacono N, Eichler EE: A preliminary comparative analysis of primate segmental duplications shows elevated substitution rates and a great-ape expansion of intrachromosomal duplications. Genome Res 16:576-583 (2006) I.F. 10.256
7. Johnson ME, Program NCS, Cheng Z, Morrison VA, Scherer S, Ventura M, Gibbs RA, Green ED, Eichler EE: Eukaryotic transposable elements and genome evolution special feature: recurrent duplication-driven transposition of dna during hominoid evolution. Proc Natl Acad Sci U S A 103:17626-17631 (2006) I.F. 9.642
8. Cardone MF, Alonso A, Pazienza M, Ventura M, Montemurro G, Carbone L, de Jong PJ, Stanyon R, D'Addabbo P, Archidiacono N, She X, Eichler EE, Warburton PE, Rocchi M: Independent centromere formation in a capricious, gene-free domain of chromosome 13q21 in Old World monkeys and pigs. Genome Biol 7:R91 (2006) I.F. 7.172
9. Cheng Z, Ventura M, She X, Khaitovich P, Graves T, Osoegawa K, Church D, DeJong P, Wilson RK, Paabo S, Rocchi M, Eichler EE: A genome-wide comparison of recent chimpanzee and human segmental duplications. Nature 437:88-93 (2005) I.F. 29.273
10. Consortium, ..., Rocchi M, Archidiacono N, Ventura M, ... Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome. Nature 437:69-87 (2005) I.F. 29.273
11. Horvath JE, Gulden CL, Vallente RU, Eichler MY, Ventura M, McPherson JD, Graves TA, Wilson RK, Schwartz S, Rocchi M, Eichler EE: Punctuated duplication seeding events during the evolution of human chromosome 2p11. Genome Res 15:914-27 (2005) I.F. 10.139
12. Newman TL, Tuzun E, Morrison VA, Hayden KE, Ventura M, McGrath SD, Rocchi M, Eichler EE: A genome-wide survey of structural variation between human and chimpanzee. Genome Res 15:1344-1356 (2005) I.F. 10.139
13. Ventura M, Boniotto M, Montemurro G, Segat L, Marziliano N, Crovella S: Comparative localization of the mannose-binding lectin-2 (MBL2) gene in non-human primates. Cytogenet Genome Res 111:186 (2005) I.F. 2.076
14. Ventura M, Weigl S, Carbone L, Cardone MF, Misceo D, Teti M, D'Addabbo P, Wandall A, Björck E, de Jong P, She X, Eichler EE, Archidiacono N, Rocchi M: Recurrent sites for new centromere seeding. Genome Res 14:1696-1703 (2004a) I.F. 10.382
15. Ventura M, Boniotto M, Pazienza M, Palumbo V, Cardone MF, Rocchi M, Tossi A, Amoroso A, Crovella S: Localization of b-defensin genes in non human primates. Eur J Histochem 48:185-190 (2004b) I.F. 0.845
16. Storlazzi CT, Anelli L, Albano F, Zagaria A, Ventura M, Rocchi M, Panagopoulos I, Pannunzio A, Ottaviani E, Liso V, Specchia G: A novel chromosomal translocation t(3;7)(q26;q21) in myeloid leukemia resulting in overexpression of EVI1. Ann Hematol 83:78-83 (2004) I.F. 1.291
17. Cardone MF, Ballarati L, Ventura M, Rocchi M, Marozzi A, Ginelli E, Meneveri R: Evolution of Beta satellite DNA sequences: evidence for duplication-mediated repeat amplification and spreading. Mol Biol Evol 21:1792-1799 (2004) I.F. 6.355
18. Boniotto M, Ventura M, Eskdale J, Crovella S, Gallagher G: Evidence for duplication of the human defensin gene DEFB4 in chromosomal region 8p22-23 and implications for the analysis of SNP allele distribution. Genet Test 8:325-7 (2004) 3

 Pubblicaizoni precedenti al triennio

19. Bailey JA, Church DM, Ventura M, Rocchi M, Eichler EE: Analysis of segmental duplications and genome assembly in the mouse. Genome Res 14:789-801 (2004) I.F. 10.382
20. Ventura M, Mudge JM, Palumbo V, Burn S, Blennow E, Pierluigi M, Giorda R, Zuffardi O, Archidiacono N, Jackson MS, Rocchi M: Neocentromeres in 15q24-26 map to duplicons which flanked an ancestral centromere in 15q25. Genome Res 13:2059–2068 (2003) I.F. 9.635
21. Ruault M, Ventura M, Galtier N, Brun ME, Archidiacono N, Roizes GG, De Sario A: BAGE genes generated by juxtacentromeric reshuffling in the hominidae lineage are under selective pressure. Genomics 81:391-9 (2003) I.F. 3.488
22. Misceo D, Ventura M, Eder V, Rocchi M, Archidiacono N: Human chromosome 16 conservation in primates. Chromosome Res 11:323-326 (2003) I.F. 2.038
23. Horvath JE, Gulden CL, Bailey JA, Yohn C, McPherson JD, Prescott A, Roe BA, De Jong PJ, Ventura M, Misceo D, Archidiacono N, Zhao S, Schwartz S, Rocchi M, Eichler EE: Using a pericentromeric interspersed repeat to recapitulate the phylogeny and expansion of human centromeric segmental duplications. Mol Biol Evol 20:1463-1479 (2003) I.F. 6.050
24. Eder V, Ventura M, Ianigro M, Teti M, Rocchi M, Archidiacono N: Chromosome 6 phylogeny in primates and centromere repositioning. Mol Biol Evol 20:1506-1512 (2003) I.F. 6.050
25. Charchar FJ, Svartman M, El-Mogharbel N, Ventura M, Kirby P, Matarazzo MR, Ciccodicola A, Rocchi M, D'Esposito M, Graves JA: Complex events in the evolution of the human pseudoautosomal region 2 (PAR2). Genome Res 13:281-286 (2003) I.F. 9.635
26. Brun ME, Ruault M, Ventura M, Roizes G, De Sario A: Juxtacentromeric region of human chromosome 21: a boundary between centromeric heterochromatin and euchromatic chromosome arms. Gene 312:41-50 (2003) I.F. 2.754
27. Ruault M, Brun ME, Ventura M, Roizes G, De Sario A: MLL3, a new human member of the TRX/MLL gene family, maps to 7q36, a chromosome region frequently deleted in myeloid leukaemia. Gene 284:73-81 (2002 ) I.F. 3.041
28. Meloni I, Vitelli F, Pucci L, Lowry RB, Tonlorenzi R, Rossi E, Ventura M, Rizzoni G, Kashtan CE, Pober B, Renieri A: Alport syndrome and mental retardation: clinical and genetic dissection of the contiguous gene deletion syndrome in Xq22.3 (ATS-MR). J Med Genet 39:359-65 (2002 ) I.F. 7.774
29. Boniotto M, Ventura M, Cardone MF, Boaretto F, Archidiacono N, Rocchi M, Crovella S: Localization of a new highly repeated DNA sequence of Lemur cafta (Lemuridae, Strepsirhini). Genome 45:973-6 (2002) I.F. 1.815
30. Carbone L, Ventura M, Tempesta S, Rocchi M, Archidiacono N: Evolutionary history of chromosome 10 in primates. Chromosoma 111:267-272 (2002) I.F. 2.829
31. Cardone MF, Ventura M, Tempesta S, Rocchi M, Archidiacono N: Analysis of chromosome conservation in Lemur catta studied by chromosome paints and BAC/PAC probes. Chromosoma 111:348-356 (2002) I.F. 2.829
32. Crosier M, Viggiano L, Guy J, Misceo D, Stones R, Wei W, Hearn T, Ventura M, Archidiacono N, Rocchi M, Jackson MS: Human paralogs of KIAA0187 were created through independent pericentromeric-directed and chromosome-specific duplication mechanisms. Genome Res 12:67-80 (2002) I.F. 9.863
33. Giglio S, Calvari V, Gregato G, Gimelli G, Camanini S, Giorda R, Ragusa A, Guerneri S, Selicorni A, Stumm M, Tonnies H, Ventura M, Zollino M, Neri G, Barber J, Wieczorek D, Rocchi M, Zuffardi O: Heterozygous submicroscopic inversions involving olfactory receptor-gene clusters mediate the recurrent t(4;8)(p16;p23) translocation. Am J Hum Genet 71:276-85 (2002) I.F. 10.649
34. Fiermonte G, Dolce V, Palmieri L, Ventura M, Runswick MJ, Palmieri F, Walker JE: Identification of the human mitochondrial oxodicarboxylate carrier. Bacterial expression, reconstitution, functional characterization, tissue distribution, and chromosomal location. J Biol Chem 276:8225-30 (2001  ) 11
35. Ventura M, Boniotto M, Cardone MF, Fulizio L, Archidiacono N, Rocchi M, Crovella S: Characterization of a highly repeated DNA sequence family in five species of the genus Eulemur. Gene 275:305-310 (2001a) 2
36. Ventura M, Archidiacono N, Rocchi M: Centromere emergence in evolution. Genome Res 11:595-599 (2001b) I.F. 9.863
37. Iacobazzi V, Ventura M, Fiermonte G, Prezioso G, Rocchi M, Palmieri F: Genomic organization and mapping of the gene (SLC25A19) encoding the human mitochondrial deoxynucleotide carrier (DNC). Cytogenet Cell Genet 93:40-2 (2001) 1-2
38. Bassi C, Magnani I, Sacchi N, Saccone S, Ventura A, Rocchi M, Marozzi A, Ginelli E, Meneveri R: Molecular structure and evolution of DNA sequences located at the alpha satellite boundary of chromosome 20. Gene 256:43-50 (2000) 1-2

   

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